Luego del sorteo realizado por la DIMAYOR, quedaron definidas las llaves de los cuartos de final de la Liga Águila II – 2017. Los equipos cabezas de serie, es decir los que clasificaron de la posición 1 a la 4, comenzarán sus compromisos como visitantes y cerrarán en casa.
Las llaves quedaron conformadas de la siguiente manera:
Llave A
Junior vs. América
Llave B
Santa Fe vs. Jaguares F.C.
Llave C
Atl. Nacional vs. Dep. Tolima
Llave D
Millonarios vs. La Equidad