Junior se convirtió en el primer finalista de la Copa Águila 2015, tras supera en su serie a Medellín. El primer partido finalizó dos por uno a favor del conjunto de Barranquilla, y en el segundo compromiso se impusieron los antioqueños por el mismo marcador. Los goles de Medellín los anotaron Juan Fernando Caicedo (27´) y Jhon Fredy Pajoy (60´), mientras Jarlan Barrera (69´) descontó para la visita. Por lo cual la serie se definió por penaltis, donde los visitantes consiguieron la clasificación al ganar 5 por 4.
Ahora Junior espera por su rival para la final, que saldrá de la llave entre Santa Fe y Once Caldas, que se jugará el 7 y 15 de octubre.