Los últimos dos cupos a las semifinales quedaron definidos con la culminación de los partidos de vuelta por los cuartos de final.
Millonarios fue el tercer club en clasificarse a las semifinales de la Liga Aguila I-2017, después de ganar en El Campín 2-0 al Bucaramanga y dejar la serie a su favor por 4-2 en el global.
El otro club que avanzó y sigue en carrera, es el Deportivo Cali que perdió por 3-1 en el Atanasio Girardot frente al Medellín, pero se quedó con la última casilla disponible con marcador global de 5-4 ante el poderoso.
De esta forma, las llaves de las semifinales en la Liga Aguila I-2017 quedaron de la siguiente manera:
Semifinal 1
Atlético Nacional vs Millonarios
Semifinal 2
Deportivo Cali vs América